賽多利斯支原體檢測(cè)試劑盒:支原體污染解決方案
支原體是最小的自由生存生物。它們屬于細(xì)菌類柔膜細(xì)菌目,其特征在于無(wú)細(xì)胞壁。因此,它們不受許多常用抗菌劑的影響。支原體是細(xì)胞培養(yǎng)中廣泛存在的污染物。由于支原體非常微?。s 0.3 - 0.8μm),無(wú)法用光學(xué)顯微鏡觀察到支原體污染,受感染細(xì)胞培養(yǎng)物中的生長(zhǎng)率和形態(tài)的改變會(huì)很小且不明顯。但是受支原體污染的產(chǎn)品會(huì)造成人類健康風(fēng)險(xiǎn)。所有這些都清楚地表明了對(duì)支原體常規(guī)檢測(cè)的高需求。
賽多利斯Microsart? ATMP支原體檢測(cè)試劑盒能夠根據(jù)《歐洲藥典》2.6.7可靠、靈敏地檢測(cè)細(xì)胞培養(yǎng)中和細(xì)胞培養(yǎng)衍生生物制品中的支原體DNA。
在本研究中,通過(guò)使用賽多利斯的定量CFU和GC標(biāo)準(zhǔn),對(duì)9種不同種類支原體基因組拷貝(GC)和菌落數(shù)(CFU)之間的相關(guān)性進(jìn)行了研究。由于PCR技術(shù)僅檢測(cè)基因組拷貝(GC),而不同的監(jiān)管部門,如韓國(guó)食品和藥品監(jiān)督管理局(KFDA)和日本藥品和醫(yī)療器械管理局(PMDA)要求在通過(guò)細(xì)胞培養(yǎng)產(chǎn)品質(zhì)量控制所用的檢測(cè)前要提供菌落數(shù)(CFU)與基因組拷貝(GC)的相關(guān)性。本研究的結(jié)果表明,盡管不同種類支原體間的基因組拷貝數(shù)不同,但都成功關(guān)聯(lián)了20 CFU或是40 CFU的比例相關(guān)性。
材料和方法
Microsart? 支原體驗(yàn)證標(biāo)準(zhǔn)品的DNA提取
Microsart? 支原體驗(yàn)證標(biāo)準(zhǔn)品的每一包裝包含3個(gè)小瓶,每個(gè)小瓶包含 10 CFU 所選支原體種類。將 250μl 杜氏最低營(yíng)養(yǎng)必需培養(yǎng)基(DMEM)+10%胎牛血清(FBS)加到兩個(gè)小瓶中,以制備一份濃度為 40 CFU/ml的懸浮液。將 500 μl DMEM +10%FBS加到一個(gè)小瓶中,以制備一份濃度為 20 CFU/ml的懸浮液。根據(jù)方案用Microsart? AMP 提取試劑盒平行提取各細(xì)胞懸浮液的DNA。洗脫液直接用于Microsart? ATMP 支原體qPCR 試劑盒檢測(cè)。
Microsart? 校準(zhǔn)試劑標(biāo)準(zhǔn)曲線
表1:針對(duì)不同種類支原體的Microsart? 支原體驗(yàn)證標(biāo)準(zhǔn)品和Microsart? 校準(zhǔn)試劑的產(chǎn)品概述。
為了量化Microsart? 支原體驗(yàn)證標(biāo)準(zhǔn)品的 DNA 提取物,有必要使用已知濃度的基因組拷貝(GC)建立一條標(biāo)準(zhǔn)曲線。因此,使用了Microsart? 校準(zhǔn)試劑。校準(zhǔn)試劑再水合后含特定細(xì)菌10? GC/μl 。在 Tris 緩沖液中制備稀釋梯度系列樣品,以使最終濃度達(dá)到5 GC/10μl 至 500 GC/10μl。
Microsart? ATMP 支原體qPCR 試劑盒
對(duì)試劑盒里所有凍干組分再水化。針對(duì)一次反應(yīng),將 15μl 的支原體混合物與 1μl 的內(nèi)標(biāo)對(duì)照 DNA 混合。將 15μl 該混合物加至每個(gè) PCR 管中。每次至少使用兩個(gè)無(wú)模板對(duì)照(NTC)進(jìn)行檢測(cè),并且平行取樣兩份。因此,將 10μl 的樣本或 NTC 分別加至帶有反應(yīng)混合物的 PCR 管中。
在熒光定量 PCR 儀 CFX96 Touch Cycler(Bio-Rad;45 個(gè)周期,3min 95 ℃,30s 95 °,30s 55 ℃,45s 60 ℃)上進(jìn)行Microsart? ATMP 支原體 qPCR 檢測(cè)。支原體DNA由一條FAM? 熒光通道中的增強(qiáng)熒光信號(hào)表示。在同一試管中的 ROX? 通道中檢測(cè)到內(nèi)標(biāo)對(duì)照DNA,該試劑盒用 FAM? 和 ROX? 雙探針來(lái)指示 PCR 檢測(cè)系統(tǒng)的正常無(wú)抑制。使用CFX Manager Software(Bio-Rad)進(jìn)行反應(yīng)分析?!稓W洲藥典》/《美國(guó)藥典》中列出的所有支原體種類的檢測(cè)限為≤10cfu/ml。
結(jié)果
圖2和3顯示了萊氏衣原體的示例性擴(kuò)增圖?;赾t值(FAM?通道)和標(biāo)準(zhǔn)濃度,CFX Manager軟件使用一個(gè)線性方程創(chuàng)建了一條標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖1)?;貧w系數(shù)0.983表明標(biāo)準(zhǔn)曲線良好。最優(yōu) qPCR 的效率為100%。在這種情況下,擴(kuò)增子 DNA 將在每個(gè)周期內(nèi)翻倍。根據(jù)對(duì) CFX 軟件的分析,萊氏衣原體的示例性 qPCR 運(yùn)行以101%的效率高效運(yùn)行(參見圖1中的效率)。
圖1:使用Microsart? ATMP支原體試劑盒產(chǎn)生的最終基因組拷貝(GC)濃度5 GC/10μl至500 GC/10μl的萊氏無(wú)膽甾原體(Microsart? 校準(zhǔn)試劑)的示例性標(biāo)準(zhǔn)曲線。
每個(gè)樣本和無(wú)模板對(duì)照(NTC)都顯示了內(nèi)標(biāo)對(duì)照DNA的一個(gè)擴(kuò)增,因此也造成了ROX?通道中的熒光信號(hào)(Ct<40;數(shù)據(jù)未示出)。表明了PCR檢測(cè)成功且無(wú)抑制。如預(yù)期,NTC在FAM?通道中未顯示熒光信號(hào)(參見圖2和圖3)。因此,表明了 PCR 反應(yīng)的無(wú)支原體制備無(wú)交叉感染。
圖2:Microsart? ATMP支原體qPCR試劑盒生成的萊氏無(wú)膽甾原體的示例性擴(kuò)增圖。
圖3:Microsart? ATMP支原體qPCR試劑盒生成的萊氏無(wú)膽甾原體的示例性擴(kuò)增圖。
已在所有樣本中成功檢測(cè)到20 CFU/ml 和40 CFU/ml 的每種支原體(測(cè)定LOD≤10cfu/ml;在試劑盒驗(yàn)證期間確定)。
基于標(biāo)準(zhǔn)曲線的線性方程,軟件計(jì)算的支原體樣本GC濃度(20CFU/ml 和 40CFU/ml 提取物)。9 種不同種類支原體的平均GC/CFU比率如表2所示。
表2: 9種不同種類支原體的平均GC/CFU率
討論
在本研究中,使用賽多利斯定量 GC 和 CFU 標(biāo)準(zhǔn)研究了 9 種不同種類支原體的基因組拷貝(GC)和菌落數(shù)(CFU)之間的相關(guān)性。研究結(jié)果表明:GC 值高于 CFU 值。理論 GC:CFU 比率應(yīng)為1:1,因?yàn)槔硐肭闆r下,每個(gè)細(xì)胞應(yīng)檢測(cè)一個(gè)GC。實(shí)際上,即使在早期指數(shù)增生期就收獲支原體培養(yǎng)物,以防止在制劑中檢測(cè)到死細(xì)胞DNA,該比率也是不可實(shí)現(xiàn)的。出現(xiàn)非等比是因?yàn)榇罅康闹гw細(xì)胞不會(huì)在培養(yǎng)基中生長(zhǎng)成菌落并不被檢測(cè)到(即,活的但非可培養(yǎng)的細(xì)胞)。此外,支原體細(xì)胞易于形成團(tuán)聚體,會(huì)被檢測(cè)為1個(gè)CFU,但實(shí)際上它結(jié)合了多個(gè)細(xì)胞,因此是好幾個(gè)GC。
這兩種情況都會(huì)嚴(yán)重低估細(xì)胞培養(yǎng)樣本中的真實(shí)支原體細(xì)胞數(shù),因?yàn)橹挥幸徊糠旨?xì)胞會(huì)生長(zhǎng)為一個(gè)CFU。使用基于生長(zhǎng)的方法,不可培養(yǎng)的物種或可生存但不可培養(yǎng)的細(xì)胞可能導(dǎo)致假陰性的結(jié)果。由于基于生長(zhǎng)的方法中的假陰性結(jié)果而未檢測(cè)到支原體污染可能會(huì)產(chǎn)生具有潛在感染風(fēng)險(xiǎn)的不安全產(chǎn)品,特別是對(duì)于免疫缺陷的患者,這種風(fēng)險(xiǎn)會(huì)更嚴(yán)重。
總結(jié)
本研究表明:GC 和 CFU 之間的相關(guān)性可以成功地被證明,并且在驗(yàn)證期間易于實(shí)施證明試驗(yàn)。另外,可以通過(guò) PCR 的 GC 檢測(cè)顯示各樣本中實(shí)際污染水平的一個(gè)更真實(shí)結(jié)果,因此直接有利于藥物安全。
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